根據您提供的信息，甲公司簽訂的不動產租賃合同規定每兩年根據過去24個月的消費者價格指數（CPI）進行調整。以下是計算租賃負債的詳細步驟：

1. **初始租賃付款額確認**：
- 合同規定，租賃期開始日的CPI為125。
- 因此，第一年和第二年的租賃付款額為50,000元。

2. **計算CPI調整后的租賃付款額**：
- 假設在第三年的調整日前的24個月內，CPI上升了1%。
- 根據公式：調整后租金 = 原租金 x (1 + (新CPI - 基礎CPI) / 基礎CPI)。
- 調整后的租金 = 50,000元 x (1 + (1%)) = 50,500元。
- 您提到的50,125元似乎是基于不同的CPI變動計算得出的，這里我們使用1%作為示例。

3. **租賃負債計量**：
- 在租賃期開始時，甲公司應以未來租賃付款的現值作為租賃負債的初始計量。
- 在CPI調整后，甲公司需要重新計算未來租金的現值，并調整租賃負債的賬面價值。
- 到了第三年，甲公司應以調整后的租金（如上計算得出的50,500元）為基礎，計算剩余租賃期間的負債現值。

針對您的問題：

“甲公司應以每年50,125元的租賃付款額為基礎計量租賃負債” 這句話并不完全準確。正確的做法是，甲公司需要根據實際的CPI調整計算出新的租賃付款額（如上所述的50,500元），并以此為基礎重新計量租賃負債。

希望以上解釋能夠幫助您完全理解租賃負債的計算方式。如果有任何其他疑問，請隨時提問，我會耐心為您解答。