參考答案

（1）黃某建議陳某買入本公司股票的行為違法，屬于內幕交易行為。根據規定，證券交易內幕信息的知情人員和非法獲取內幕信息的人員，在內幕信息公開前，不得買賣該公司的證券，或者泄露該信息，或者建議他人買賣該證券。在本案中，W合作項目是A公司的重大投資行為，屬于內幕信息，黃某作為內幕信息的知情人員建議他人買入股份的行為違法。
（2）黃某將其持有的A公司股票全部售出的行為違法。根據規定，公司董事、監事、高級管理人員在任職期間每年轉讓的股份不得超過其所持有本公司股份總數的25%。在本案中，黃某作為A公司的董事長將其持有的A公司股票“全部”售出的行為違法。
（3）抵押合同中有關“若A公司到期不能償還借款，該生產設備歸B銀行所有”的約定無效。根據規定，訂立抵押合同時，抵押權人和抵押人不得約定在債務履行期限屆滿抵押權人未受清償時，抵押物的所有權直接歸債權人所有。但是，該條款的無效不影響抵押合同其他條款的效力。
（4）向原股東配售5000萬元的數額違法。根據規定，上市公司配股的，擬配售股份的數量不超過本次配售股份前股本總額的30%。在本案中，擬配售5000萬元超過了配售股份前股本總額（股本總額=注冊資本）1億元的30%。
（5）股東大會通過配股方案的決議違法。根據規定，上市公司配股屬于增資事項，應當經出席股東大會的股東所持表決權2/3以上通過。在本案中，A公司股東大會贊成該事項的表決權僅為出席會議的股東所持表決權的62%（31%÷50%）。
（6）股東大會通過購買重要生產設備的決議違法。根據規定，上市公司一年內出售、購買重大資產，或者對外提供擔保金額超過資產總額30%的，應當經出席股東大會的股東所持表決權2/3以上通過。在本案中，該重要生產設備投資額為7000萬元，已經超過資產總額2億元的30%，而A公司股東大會贊成該事項的表決權僅占出席會議的股東所持表決權的30%（15%÷50%）。