中醫執業醫師和中醫助理醫師的主要區別在于職業資格和職責范圍。

1. 職業資格：中醫執業醫師是經過國家中醫藥管理部門考核合格的，取得中醫執業醫師證書的醫師，具有獨立執業的資格；而中醫助理醫師則是指具有中醫專業大專以上學歷或中醫學徒制培訓合格證書的人員。

2. 職責范圍：中醫執業醫師可以獨立診斷、治療疾病，開具中藥處方和進行針灸等治療；而中醫助理醫師則需要在中醫執業醫師的指導下，協助進行中醫診斷和治療、制定治療方案、配制中藥等。

總體來說，中醫執業醫師的職業資格和職責范圍更廣，具有更高的醫療權威性和責任性，而中醫助理醫師則是在中醫執業醫師的指導下，協助完成醫療工作的人員。